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当然，对克隆战士进行的改造不需要杨屹亲自动手。
在这几天里，他不但制造了一千台改造设备，还对玉明震提供的一个智能程序做了一些改动。
这个智能程序，其实也是杨屹的“熟人”，即“暗影”号上的阿伦。
虽然“暗影”号早已在战争中损毁，但是阿伦的基础程序保存了下来，只是因为没有合适的战舰，所以一直储存在军部的数据库里。杨屹所做的，也只是让阿伦具备基本的情感因素。虽然远远无法跟杨二相比，但是控制一千台改造设备，对一千名克隆战士进行改造，显然难不倒阿伦。
事实上，像阿伦这样的智能程序，最大的价值就是代替人类做一些繁杂的工作。这些智能程序能够控制最大的战舰，而主力舰上有成千上万的设备，还需要及时处理众多信息，相对而言，一千台改造设备根本不算多，而且所有克隆战士的改造工作同时进行，因此处理的信息也不算复杂。
做好一切安排之后，杨屹就把改造工作交给了阿伦。
当然，他也没闲着。在对一千名克隆战士进行改造的同时，杨屹动手制造了更多的改造设备。如果需要对两千万名战士进行改造，那么别说是一千台，就算是十万台，甚至一百万台改造设备也不够。虽然没有把握制造足够多的改造设备，但是这个时候，杨屹也只能走一步看一步了。
十日后，第一批克隆战士的改造工作完成。
他们原本就是战兵，而且获得了由杨屹提供的圣器，所以在完成改造之后，他们并不需要花多少时间进行训练。唯一要做的，只是熟悉玉家制造的皇级战机，因为只有驾驶皇级战机，这些完成了改造的克隆战士才能跟那些拥有座架的战皇匹敌。很明显，硅魅联盟的战皇来到南阿尔法星系，其中一些肯定有座驾，而且肯定是十二级以上的硅兽，也许还是凶猛的野生硅兽。就算并不是所有战皇都有，但是只要有一名战皇拥有座驾，那么与之遭遇的人类战士就需要皇级战机。
当然，玉家的皇级战机生产线一直在全速运转，提供一千架皇级战机不是什么难事。随着极境族提供的支持逐渐发挥作用，皇级战机的产量也得到了提升。用玉明震的话来说，基本上能够满足武装人类战士的需求。等到航线打通，跟极境族取得联系，还能获得由极境族制造的皇级战机。
一切准备就绪之后，杨屹给这些克隆战士安排了任务。
他们的使命不是去收复那些被战皇攻占的恒星系，也不是去找战皇决战，而是去搞清楚各个恒星系的情况，特别是战皇的活动情况，以及敌人在各个恒星系里做的事情，比如有没有对星球进行环境改造。
显然，杨屹没有想过靠一千名克隆战士扭转局面。
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